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Omega CEは、現在フリーで機能は限定されたベータ版で、Windows内では動作しません。その代わりに、それをCDに焼いてから、そのCDから感染したPCを起動します。その後、Omegaはハードドライブ上のすべてのファイルをチェックインし、エクスプローラのようなインターフェイスで表示します。既知のマルウェアファイルを検索して無効にするオプションがあります。
ファイルを検索するには、ファイル名を事前に知っておく必要があります。または、表示されているファイルとフォルダを手動でクリックして、後で実行しているものを見つけることもできます。 Omega CEの作成者は、インストールされているWindowsのバージョンに関係なく、NTFSファイルシステム（Windowsで一般的に使用される）に保存されたファイルで動作すると言います。
Omega CEにはPS2のキーボードとマウスが必要で、USB品種また、現在のベータ版は160,000のファイルまたはディレクトリのみを表示し、セッションごとに10を無効にすることに制限されています。オメガCEがベータ版から出ると、有料のプログラムになります。